Der Magerrasen-Perlmutterfalter ist im Vergleich zum Kleinen Perlmutterfalter ein seltener Falter, zumindest je nördlicher man in Deutschland kommt. Er ist zudem etwas kleiner, hat eine andere Flügelform und ein gänzlich anderes Perlmutt-Muster auf der Flügelunterseite. Er ist jedoch mit geöffneten Flügeln im Feld trotzdem schwer vom kleinen Perlmutterfalter zu unterscheiden. Bei einem genaueren Blick fallen allerdings auch Unterschiede im Fleckenmuster auf den Oberseiten auf, sowie ein gänzlich anderer Flügelsaum.